Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms