Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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