Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SETD1BQ9UPS6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms