Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
L1RE1Q9UN81 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms