Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMPRSS11EQ9UL52 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms