Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms