Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms