Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms