Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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