Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GDE1Q9NZC3 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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GDE1Q9NZC3 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GDE1Q9NZC3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GDE1Q9NZC3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GDE1Q9NZC3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GDE1Q9NZC3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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GDE1Q9NZC3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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