Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms