Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PFDN4Q9NQP4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PFDN4Q9NQP4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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PFDN4Q9NQP4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PFDN4Q9NQP4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PFDN4Q9NQP4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PFDN4Q9NQP4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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