Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB18Q9NP72 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms