Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3GQ9HC16 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms