Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C11orf49Q9H6J7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms