Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms