Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZCCHC2Q9C0B9 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms