Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FOXQ1Q9C009 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXQ1Q9C009 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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