Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms