Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPS6-204ENST00000380394 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC102945.2-201ENST00000623026 1422 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 CAPN3-202ENST00000337571 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 PAGE1-201ENST00000376150 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 CAPN3-208ENST00000397204 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 TXNRD3NB-201ENST00000404489 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL392172.1-205ENST00000435378 768 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC105942.1-202ENST00000438509 952 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC093827.3-201ENST00000514631 1110 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC046195.2-201ENST00000519652 541 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC104051.1-201ENST00000520426 570 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP003721.2-201ENST00000536495 452 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL358333.3-201ENST00000553603 479 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 CHORDC2P-201ENST00000557601 1090 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNX11-206ENST00000580219 1200 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms