Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms