Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC46A2Q9BY10 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC46A2Q9BY10 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms