Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TDRD1Q9BXT4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TDRD1Q9BXT4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TDRD1Q9BXT4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TDRD1Q9BXT4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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