Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms