Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
VAMP8Q9BV40 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VAMP8Q9BV40 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms