Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ATG101Q9BSB4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms