Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GORASP1Q9BQQ3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms