Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms