Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT140Q96RY7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms