Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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