Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIC2Q96JB3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIC2Q96JB3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms