Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDAC11Q96DB2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms