Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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