Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms