Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms