Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms