Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms