Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms