Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms