Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms