Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCTP1Q6DN14 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCTP1Q6DN14 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms