Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM5

PRAMEF9, PRAME family member 9/15, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF9Q5VWM5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF9Q5VWM5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF9Q5VWM5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF9Q5VWM5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms