Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01545Q5VT33 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms