Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNT1Q5JUK3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms