Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms