Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SFT2D3Q587I9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SFT2D3Q587I9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SFT2D3Q587I9 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SFT2D3Q587I9 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SFT2D3Q587I9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SFT2D3Q587I9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SFT2D3Q587I9 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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SFT2D3Q587I9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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