Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB6CQ53S08 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms