Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 HGNC:18790-209ENST00000513555 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 DCT-202ENST00000446125 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PLAT-204ENST00000429710 1655 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MPP7-202ENST00000375719 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PCAT18-201ENST00000579458 2598 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ADCY4-204ENST00000554068 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CYP26B1-202ENST00000412253 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 C8A-201ENST00000361249 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms