Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms