Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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